生化培菌的周期取决于废水的水温和水质。水温高于15℃以上时，培菌的过程较快，水温低于15℃以下时则污泥驯化时间较长，因此污泥的培养驯化应尽量选择在5-11月期间（长江流域）进行。就废水的水质而言，无毒无害、易生物降解的废水，其生化培菌的时间一般在10-20天，而有毒有害、难生物降解的废水，则需要一个较长的过程，约需30-60天，甚至更长。